tengo una pagin en la que coloque 7 checkbox....y los mande a aun script para tomar el valor de los que han sido seleccionados...y son alamcenados en un arreglo.....lo que me gustaria saber como puedo asignar el valor que ha tomado de los asignados  a un input hidden...ó de que manera podria hacerle.....espeero y me puedan ayudar......

Hola, pues desde java simplemente tendrias que hacer algo como:

Nombre_Formulario.Nombre_CajaOculta.text=Valor_A_Asignar

No se si es eso lo que buscas, pero espero te sea util en algo.